Организация и управление научно-исследовательской деятельностью во Владимирском филиале РАНХиГС осуществляется непосредственно заместителем директора филиала (по направлению научной работы) и заведующими кафедрами. На каждой кафедре имеются индивидуальные планы работы преподавателей на учебный год, на заседаниях кафедр ежегодно утверждаются тематика научных исследований, планы научной работы и отчеты по НИД. Вопросы научно-исследовательской работы рассматриваются почти на каждом заседании ученого совета филиала. Отчет по результатам научно-исследовательской деятельности формируется ежегодно, по окончании календарного года.

Система научно-исследовательской работы включает:
- научный и профессиональный рост профессорско-преподавательских кадров;
- выполнение научной и научно-исследовательской работы преподавателями филиала;
- руководство научно-исследовательской деятельностью студентов и слушателей.

В филиале действует научная школа «Стратегическое развитие организаций» (НШ сертификат №00123 от 2008 г.) под руководством доктора экономических наук, профессора Ю.Н. Лапыгина. Итогом работы научной школы к настоящему моменту времени является подготовка к защите 57 к.э.н. и 3 д.э.н., публикация 46 монографий и более 30 учебников, в т.ч. 12 с грифом.

Приоритетными научными направлениями, по которым ведутся основные научно-исследовательские работы в филиале, Ученым советом филиала определены следующие:
- Развитие государственного и муниципального управления на региональном уровне;
- Правовое обеспечение государственного и муниципального управления;
- Оценка эффективности деятельности государственных и муниципальных служащих;
- Стратегическое управление социально-экономическим развитием региона;
- Изучение социального самочувствия жителей Владимирской области;
- Создание прогностических моделей эволюции природных, живых и социально-экономических систем на основе конечных групп нарушений симметрии.

Некоторыми кафедрами эти темы были уточнены или расширены. Так, в рамках специализаций обучения, в филиале сотрудниками кафедры экономики разрабатываются следующие темы:
- бюджетные потоки в регионе;
- повышение инвестиционной привлекательности региона;
- система управления экономикой региона.

В соответствие с этими приоритетными направлениями в 2018 году выполнялись следующие хоздоговорные научно-исследовательские работы:

Профессорско-преподавательский состав филиала регулярно участвует в конкурсах, проводимых РФФИ, РАНХиГС и администрацией Владимирской области.
Так, в 2017 и 2018 годах грант Российского фонда фундаментальных исследований осуществлялся по проекту: «Социокультурный потенциал Владимирской области: динамика модернизационных процессов» (руководитель – д.п.н., доцент Е.А. Плеханов). В 2018 году началось выполнение проекта РФФИ на тему: «Создание прогностических моделей эволюции природных, живых и социально-экономических систем на основе конечных групп нарушенной симметрии» (руководитель – д.ф.-м. наук, профессор В.Г. Рау). Доцент кафедры менеджмента, кандидат экономических наук А .И. Абдряшитова и старший преподаватель кафедры экономики А.А. Анатольев стали победителями областного конкурса молодых ученых.

Большое внимание в филиале уделяется развитию публикационной активности ППС. Ученым советом принято решение о премировании преподавателей филиала за публикацию статей в индексируемых периодических изданиях, включенных в перечень ВАК, в базы данных Scopus и Web of Science.
За последние пять лет в среднем за год издавалось по 12 монографий в расчете на 100 основных штатных педагогических работников с учеными степенями и (или) званиями.
Ежегодно по предложениям кафедр ученым советом утверждается план издательской деятельности, все труды преподавателей, как правило, публикуются в существующем в филиале структурном подразделении – редакционно-издательском отделе, имеющем свою мини-типографию. Кроме этого, издаются журнал «Ученые записки», газета «Студенческий вестник».

В филиале регулярно проводятся международные, общероссийские и межвузовские научно-практические конференции.
Вкладом ученых филиала РАНХиГС в обсуждение областных проблем стали проводимые в мае научно-практические конференции на тему «Региональная экономика: проблемы и перспективы», участниками которой являются представители всех вузов Владимира, а также Ивановской, Нижегородской и многих других областей РФ, США, Китая и др. стран. К этим конференциям также издаются сборники статей. Эти (майские) конференции посвящены памяти профессора Гутмана Геральда Викторовича («Гутманские чтения»).
Ежегодно в марте-апреле проводятся международные конференции по правовой тематике. Их организация осуществляется совместно с Западным Иллинойским университетом. Традиционными стали также конференции, проводимые совместно с Административным институтом провинции Юньнань КНР. С 2003 года ежегодно в декабре на базе филиала проводятся научно-практические конференции молодых ученых Владимирской области по проблемам стратегического управления.
Конференции, проведенные в 2018 г.:

Научно-исследовательская работа студентов: Аспирантам, студентам и слушателям Владимирского филиала РАНХиГС предоставляется возможность принимать непосредственное участие во всех проводимых научно-исследовательских работах филиала, конференциях, выпусках сборников научных статей и т.д. Действуют Совет молодых ученых и Студенческое научное общество. Ежегодно проводятся отдельные конкурсы научных работ студентов по четырем номинациям: экономика, управление, юриспруденция, информационные технологии. Все эти работы публикуются в специальном сборнике по результатам конкурса.